Sémaphore vient du grec séma, signe et phoros, qui porte. Il désigne un poste de signalisation à terre qui communique par des signaux optiques avec les navires.
L'ancien sémaphore de Molène a été construit en 1877 à l'emplacement d'une cabane, portant mât de signalisation en bois, installée dès 1806. La tour a été érigée en 1908. La fonction de surveillance est doublée par celle, civile, de bureau télégraphique. Le sémaphore assure les missions d'assistance aux navires, de régulation du trafic maritime et d'observation météorologique avant d'être transférées en 1983 au CROSS-CORSEN et aux sémaphores de Ouessant et du Conquet.
Le sémaphore de Molène abrite aujourd'hui un centre d'interprétation dédié à l'histoire des sémaphores, des signaux de navigation et des sauvetages en mer.
Le dernier étage a été déconstruit lors de la restauration, redonnant au sémaphore son aspect initial. Les logements de fonctions construits fin années 1960 accueillent maintenant l'école primaire et le collège du Ponant.